平台简介
BRCA-Express 是一个面向乳腺癌转录组研究的在线分析平台,整合 TCGA-BRCA 与 15 个 GEO 独立队列的 基因表达与临床随访数据。平台支持任意基因的表达分布比较、双基因相关性分析、 Kaplan-Meier 生存分析,并提供特色功能——跨队列随机效应 Meta 分析, 以合并风险比(pooled HR)、异质性指标(I²)和森林图系统评估基因的预后价值。
使用指南 · How to use
- 1在「基因信息」页输入基因名(如 ESR1、MKI67),确认该基因已被收录。
- 2进入「表达分析」查看其在各队列的分布;选择 TCGA-BRCA 可按 Stage / PAM50 分层。
- 3在「生存分析」选择单个队列查看 KM 曲线,或选择「跨队列 Meta」获得合并风险比与森林图。
- 4所有结果均可在页面内或「数据下载」页导出为 CSV / PNG / PDF,用于论文图表。
功能模块
Gene Information
基因信息
按 symbol 检索 59,000+ 注释基因,查看 Ensembl ID、染色体定位与数据覆盖情况。
Expression
表达分析
任意基因在 16 个队列中的表达分布;TCGA 可按 Stage / PAM50 分子分型分层,附箱线图与小提琴图。
Correlation
相关性
双基因 Spearman / Pearson 相关,交互式散点图含最小二乘拟合线。
Survival & Meta-analysis
生存分析
Kaplan-Meier 曲线 + Cox 风险比;核心功能为跨队列随机效应(REML)Meta 分析与森林图。
Download
数据下载
逐样本表达值 CSV、出版级 PNG(150 dpi)与矢量 PDF 图表一键导出。
数据队列
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